Protein–RNA interactions for Protein: A2A8C4

Gm13040, Predicted gene 13040, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13040A2A8C4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13040A2A8C4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms