Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam171a2A2A699 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam171a2A2A699 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms