Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trav12-2A0N8N6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trav12-2A0N8N6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trav12-2A0N8N6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trav12-2A0N8N6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trav12-2A0N8N6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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