Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms