Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930544D05RikJ3QK56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930544D05RikJ3QK56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930544D05RikJ3QK56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
4930544D05RikJ3QK56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms