RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.81■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.81■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NEMP2A6NFY4 417 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CSPG5O95196 566 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PNPLA4P41247 253 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NRCAMQ92823 1304 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RAB10P61026 200 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SCAPQ12770 1279 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SV2CQ496J9 727 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF280DQ6N043 979 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 EME1Q96AY2 570 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SDHDO14521 159 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 MTSS1O43312 755 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 HDCP19113 662 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PRKAA2P54646 552 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM219BQ5XKK7 198 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RAD54BQ9Y620 910 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 LRIG2O94898 1065 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM200BP0CF97 657 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 STMN1P16949 149 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 DAOAP59103 153 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SNX31Q8N9S9 440 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 C7orf72A4D263 438 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 E7ENX8 843 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CAPNS1P04632 268 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PSME3P61289 254 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CNSTQ6PJW8 725 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 WDCPQ9H6R7 721 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PLK2Q9NYY3 685 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 MMP3P08254 477 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 FGFR3P22607 806 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ARNTP27540 789 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PCSK6P29122 969 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 HCAR3P49019 387 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RALGDSQ12967 914 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 APOFQ13790 326 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PRPSAP1Q14558 356 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CYTH1Q15438 398 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 GPC2Q8N158 579 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 IPMKQ8NFU5 416 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 POMKQ9H5K3 350 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 VTA1Q9NP79 307 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SBF1O95248 1867 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM38O00635 465 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 STRNO43815 780 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SMPD1P17405 629 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RANBP1P43487 201 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 LRTOMTQ8WZ04 291 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 DPF3Q92784 378 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 ASB9Q96DX5 294 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 VAT1Q99536 393 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM200B-202ENST00000521452 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms