RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585323.5

NEDD4L-210, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 381 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-210	ENST00000585323	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TISP43	B9A030	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	PER2	O15055	1255 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TBX10	O75333	385 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	GCNT3	O95395	438 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	MYB	P10242	640 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	KCNA5	P22460	613 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	LTBR	P36941	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24	3e-6	■■□□□ 12.9
NEDD4L-210	ENST00000585323	KCNQ1	P51787	676 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ASIC1	P78348	528 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	KCNA1	Q09470	495 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ALCAM	Q13740	583 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	DUSP6	Q16828	381 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TLE6	Q9H808	572 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	OGT	O15294	1046 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	KIF4A	O95239	1232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	GLP2R	O95838	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SOD2	P04179	222 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CLTA	P09496	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	KCNE1	P15382	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CASP1	P29466	404 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TNFSF9	P41273	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ADAM15	Q13444	863 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	KCNC3	Q14003	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	KYAT1	Q16773	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CXCL14	O95715	111 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CXCL8	P10145	99 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SYK	P43405	635 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	AFM	P43652	599 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	NDUFA8	P51970	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	EHHADH	Q08426	723 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CUL4B	Q13620	913 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	UROC1	Q96N76	676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	LILRB3	O75022	631 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	UROD	P06132	367 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ADRB2	P07550	413 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	BMP1	P13497	986 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	ADSS	P30520	456 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	CA8	P35219	290 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-210	ENST00000585323	NDUFV1	P49821	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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