RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227089.1

Ankrd28-204, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

BASIC

Gene Ankrd28, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01783 136 aa3.65□□□□□ -1.82
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Odf3Q920N1 254 aa3.65□□□□□ -1.82
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rnf114Q9ET26 229 aa3.65□□□□□ -1.82
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zfp119aQ9JIC0 545 aa3.65□□□□□ -1.82
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv6-15A0A140T8M5 115 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01811 117 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tcl1b4P56844 120 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem86bQ497J1 226 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm6040Q4QY32 63 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 GaptQ8CB93 157 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pear1Q8VIK5 1034 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prr13Q9CQJ5 137 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Defa1P11477 93 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Reg3bP35230 175 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ly6gP35461 111 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav6-2Q5R1I4 113 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa3.65□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gcn1E9PVA8 2671 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nat8b-psE0CYC6 232 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nxph4G3X9N5 304 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm5294J3QP53 216 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 BokO35425 213 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01756 117 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01757 117 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 OxtP35454 125 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pde6hP61249 83 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Samd5Q3V1H9 173 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cysrt1Q9D1E4 142 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Shisal2aA2A9G7 189 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 E130114P18RikF6S0S7 154 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Vsig4F6TUL9 280 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv3-6P18531 116 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 NdpP48744 131 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 A230072I06RikQ3UUJ8 172 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Crip3Q6Q6R3 243 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 March3Q8BRX9 218 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm5105Q8C6Y9 112 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ormdl2Q9CQZ0 153 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Shisa9Q9CZN4 424 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Q9D131 166 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fstl3Q9EQC7 256 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 MtorQ9JLN9 2549 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv5-6A0A075B5Q0 117 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm33815A0A087WNV3 176 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Umad1E0CX23 159 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm933J3QPC1 141 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm1968Q3T9I3 115 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 7420426K07RikQ3UX66 186 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mustn1Q99JI1 82 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Znf672Q99LH4 468 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Atp5lQ9CPQ8 103 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gemin7Q9CWY4 129 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 CstadQ9D245 104 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pradc1Q9D9N8 188 aa3.64□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dlx6P70397 175 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 ElaneQ3UP87 265 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Olfr312Q7TRZ9 308 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm9949Q8C9F4 104 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Timm23Q9WTQ8 209 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Xirp2Q4U4S6 3784 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv19-93A0A0G2JFZ3 115 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Samd13D3YUG0 102 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tcrg-C3L7N479 172 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ndufa1O35683 70 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P03985 172 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 BC048502Q80Y74 154 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm12689Q8BQU9 117 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm14137Q8CE97 175 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Foxi1Q922I5 372 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Bean1Q9EQG5 255 aa3.63□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-37A0A0A6YW32 117 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 A0A286YE02 88 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cox7a1P56392 80 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ttc9cQ810A3 171 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Fhl4Q8CDC8 279 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rnase2aQ8K196 155 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 SNORCQ9CXL7 121 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Wnk1P83741 2377 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 DscamQ9ERC8 2013 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ins2P01326 110 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 CrygbP04344 175 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tcf15Q60756 195 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm10277Q6R5C6 214 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Psmb11Q8BG41 302 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Icam4Q9ERM2 262 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Amn1B8JKV0 258 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa3.62□□□□□ -1.83
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rasl10aQ8K5A4 203 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 115.6 ms