RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.3□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 SMIM12Q96EX1 92 aa11.3□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 TGP01266 2768 aa11.3□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 F8W036 122 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 AMBPP02760 352 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 GPX1P07203 203 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 SMUG1Q53HV7 270 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 SEC11CQ9BY50 192 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 CSTL1Q9H114 145 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 NAT8Q9UHE5 227 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.29□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 BTN1A1Q13410 526 aa11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 MRAPQ8TCY5 172 aa11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 XCL2Q9UBD3 114 aa11.28□□□□□ -0.6
CTU2-209ENST00000567316 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 C7orf71A4D174 169 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 K7EN84 100 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 GCGP01275 180 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 CRIP1P50238 77 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 RPL23P62829 140 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 Q6ZQT7 251 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 LINC01551Q86U37 167 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.27□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 APOC4P55056 127 aa11.26□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 OR5I1Q13606 314 aa11.26□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 Q6AWC8 147 aa11.26□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 INSP01308 110 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 PRR27Q6MZM9 219 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 BIN3Q9NQY0 253 aa11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 SH2D1AO60880 128 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 ADIRFQ15847 76 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 MUC4Q99102 2169 aa11.24□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.23□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 UBE2CO00762 179 aa11.23□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.23□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 ISOC2Q96AB3 205 aa11.23□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.22□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.21□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.21□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 NUDT11Q96G61 164 aa11.21□□□□□ -0.61
CTU2-209ENST00000567316 APOC3P02656 99 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 DEFB135Q30KP9 77 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 MUC21Q5SSG8 566 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 LINC01587Q99440 93 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 OSTCQ9NRP0 149 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa11.2□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 H7BYZ3 331 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 ERVFC1-1P60608 527 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 LINC01559Q495D7 138 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 Q6ZWC4 215 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 SFRP2Q96HF1 295 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 NAGKQ9UJ70 344 aa11.19□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 NACAE9PAV3 2078 aa11.18□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 M0R036 132 aa11.18□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTU2-209ENST00000567316 P01737 135 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.7 ms