RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PPA2Q9H2U2 334 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 A0A0G2JK05 382 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 A0A1W2PPK0 400 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 GPX5O75715 221 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CDRT1O95170 752 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MAS1P04201 325 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ARG1P05089 322 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CSN2P05814 226 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LMO1P25800 156 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CFPP27918 469 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TGFBR2P37173 567 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IER3P46695 156 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DLX6P56179 175 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SLC35A2P78381 396 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DOC2BQ14184 412 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 GPR176Q14439 515 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SPHARQ15513 63 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 HCP5Q6MZN7 132 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OSR2Q8N2R0 312 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR4F5Q8NH21 305 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 UFD1Q92890 307 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ORAI1Q96D31 301 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DERL3Q96Q80 235 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ING3Q9NXR8 418 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RAB26Q9ULW5 256 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 STAB1Q9NY15 2570 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 A0A1B0GUS0 222 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ODAMA1E959 279 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 HSPB6O14558 160 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 GPR137BO60478 399 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SERPINA2P20848 420 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 VHLP40337 213 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 KCNJ3P48549 501 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RAG2P55895 527 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 AESQ08117 197 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PIGYQ3MUY2 71 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 AWAT2Q6E213 333 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR52W1Q6IF63 320 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 Q6P435 159 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ASCL4Q6XD76 172 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TCF23Q7RTU1 214 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LINC00596Q86U02 117 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CDH26Q8IXH8 852 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TMED9Q9BVK6 235 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 Q9H521 79 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 BEX1Q9HBH7 125 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IL36GQ9NZH8 169 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MEGF11A6BM72 1044 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 POM121CA8CG34 1229 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 HSMCR30P0CW71 290 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 GTF2F2P13984 249 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 OMGP23515 440 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 CRHBPP24387 322 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 GLP1RP43220 463 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 GLIPR1P48060 266 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 Q8NFD4 153 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.46□□□□□ -0.9
GGA3-204ENST00000578208 NDNFQ8TB73 568 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms