RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SCN1BQ07699 218 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ACSM1Q08AH1 577 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RIPK1Q13546 671 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF273Q14593 569 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RSU1Q15404 277 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DDI2Q5TDH0 399 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C16orf87Q6PH81 154 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C3orf56Q8N813 242 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PXT1Q8NFP0 134 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TNFRSF14Q92956 283 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF714Q96N38 554 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CHST6Q9GZX3 395 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DNHD1Q96M86 4753 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TMEM82A0PJX8 343 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 GABRPO00591 440 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DEGS1O15121 323 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR2H2O95918 312 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RBP4P02753 201 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF728P0DKX0 622 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CELP19835 753 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MYF6P23409 242 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 COX7A1P24310 79 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DLX1P56177 255 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LGALS4P56470 323 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 BDH1Q02338 343 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF529Q6P280 563 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CHST4Q8NCG5 386 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PSPNO60542 156 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 HTR3BO95264 441 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IGHV4-59P01825 116 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CD1AP06126 327 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 FSTP19883 344 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR3A1P47881 315 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 P2RX3P56373 397 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 IL13RA2Q14627 380 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MIDNQ504T8 468 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 AWAT1Q58HT5 328 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RNLSQ5VYX0 342 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RNF144BQ7Z419 303 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PNKDQ8N490 385 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR14A2Q96R54 314 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CHIAQ9BZP6 476 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 METTL9Q9H1A3 318 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ING4Q9UNL4 249 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 C17orf98A8MV24 154 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RGS10O43665 173 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CLPXO76031 633 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ATP6V1G2O95670 118 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 PTGFRP43088 359 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR3A4PP47883 348 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 MED22Q15528 200 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 ELP2Q6IA86 826 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 OR5R1Q8NH85 324 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 DYRK2Q92630 601 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-204ENST00000578208 CNBD2Q96M20 576 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms