RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM210	A6NLX4	147 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BHLHE40	O14503	412 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYB5B	O43169	146 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLDN7	O95471	211 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DIRAS3	O95661	229 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WNT11	O96014	354 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SOD2	P04179	222 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THY1	P04216	161 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GUSB	P08236	651 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR3A1	P47881	315 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERVFRD-1	P60508	538 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL13RA1	P78552	427 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C4orf17	Q53FE4	359 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AWAT2	Q6E213	333 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM205	Q6UW68	189 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADGRG7	Q96K78	797 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNG8	Q9UK08	70 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A8MXE2	369 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTAG2	O75638	210 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOSL2	P15408	326 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGFALS	P35858	605 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPY4R	P50391	375 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	B4GALNT1	Q00973	533 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF774	Q6NX45	483 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MED27	Q6P2C8	311 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZG16B	Q96DA0	208 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNRHR2	Q96P88	292 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHB2	Q99623	299 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEH1	Q9H213	219 aa		9.46	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGB1BP1	O14713	200 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TGOLN2	O43493	480 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDELR3	O43731	214 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSN2	P05814	226 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ELFN1	P0C7U0	828 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF735	P0CB33	412 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCR4	P51679	360 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAS2R19	P59542	299 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DECR1	Q16698	335 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIDN	Q504T8	468 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PGA3	P0DJD8	388 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNF1A	P20823	631 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP2R1B	P30154	601 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CARD18	P57730	90 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERVFC1-1	P60608	527 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNMB1	Q16558	191 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM219A	Q8IW50	185 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMER3	Q8N944	861 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC6A7	Q99884	636 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPH1	Q9BZG8	443 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OBSL1	O75147	1896 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658		B4E171	279 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIAH2	O43255	324 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GMFG	O60234	142 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LILRB3	O75022	631 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM127	O75204	238 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AIFM1	O95831	613 aa		9.44	□□□□□ -0.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC2A5	P22732	501 aa		9.44	□□□□□ -0.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms