Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MADCAM1Q13477 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms