Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SEC23AQ15436 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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