Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SEC23AQ15436 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SEC23AQ15436 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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