Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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