Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SEC23AQ15436 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SEC23AQ15436 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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