Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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SEC23AQ15436 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SEC23AQ15436 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SEC23AQ15436 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SEC23AQ15436 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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