Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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