Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23AQ15436 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23AQ15436 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEC23AQ15436 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEC23AQ15436 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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