Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHHQ15465 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHHQ15465 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHHQ15465 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHHQ15465 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHHQ15465 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHHQ15465 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHHQ15465 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SHHQ15465 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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