Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SHHQ15465 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHHQ15465 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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