Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SHHQ15465 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SHHQ15465 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SHHQ15465 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SHHQ15465 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHHQ15465 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHHQ15465 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SHHQ15465 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SHHQ15465 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SHHQ15465 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms