Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Mvb12aQ78HU3 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Mvb12aQ78HU3 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms