Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI0

PARVG, Gamma-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVGQ9HBI0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARVGQ9HBI0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARVGQ9HBI0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms