Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC13A4Q9UKG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms