Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D3AQ9BRG2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms