Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D3AQ9BRG2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms