Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB3CQ96E17 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms