Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC45Q96CN5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms