Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB3CQ96E17 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3CQ96E17 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms