Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC45Q96CN5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.6 ms