Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUFIP1Q9UHK0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NUFIP1Q9UHK0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUFIP1Q9UHK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUFIP1Q9UHK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms