Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFXAPO00287 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFXAPO00287 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFXAPO00287 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1162.6 ms